Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mvb12aQ78HU3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Mvb12aQ78HU3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mvb12aQ78HU3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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