Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy1Q76LS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms