Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1cQ76I25 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1cQ76I25 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms