Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nme8Q715T0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nme8Q715T0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nme8Q715T0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms