Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd4Q6ZPR5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smpd4Q6ZPR5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms