Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Glis3Q6XP49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Glis3Q6XP49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Glis3Q6XP49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Glis3Q6XP49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Glis3Q6XP49 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Glis3Q6XP49 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Glis3Q6XP49 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Glis3Q6XP49 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Glis3Q6XP49 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Glis3Q6XP49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms