Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc44a1Q6X893 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc44a1Q6X893 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a1Q6X893 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms