Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asic3Q6X1Y6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic3Q6X1Y6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic3Q6X1Y6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms