Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300lfQ6SJQ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms