Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc57Q6PHN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc57Q6PHN1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms