Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd4Q6PDQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Chd4Q6PDQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd4Q6PDQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms