Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbtb39Q6PDK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbtb39Q6PDK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb39Q6PDK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms