Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcc2Q6PDG5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarcc2Q6PDG5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc2Q6PDG5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms