Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD26

Pigs, GPI transamidase component PIG-S, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigsQ6PD26 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigsQ6PD26 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PigsQ6PD26 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PigsQ6PD26 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PigsQ6PD26 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PigsQ6PD26 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PigsQ6PD26 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PigsQ6PD26 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PigsQ6PD26 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms