Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc117Q6PB51 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc117Q6PB51 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms