Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcrQ6PAJ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms