Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp49Q6P9L4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms