Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam222bQ6P539 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam222bQ6P539 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms