Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slx4Q6P1D7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Slx4Q6P1D7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slx4Q6P1D7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Slx4Q6P1D7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms