Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptpdc1Q6NZK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Ptpdc1Q6NZK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms