Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23ipQ6NZC7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec23ipQ6NZC7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms