Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tvp23aQ6NVH0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tvp23aQ6NVH0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23aQ6NVH0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms