Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelbQ6NVF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms