Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spin2cQ6NVE3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spin2cQ6NVE3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms