Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc66Q6NS45 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms