Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mvb12bQ6KAU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms