Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm4Q6IRU2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms