Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt40Q6IFX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt40Q6IFX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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