Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf8Q6DID3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf8Q6DID3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf8Q6DID3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms