Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdc5lQ6A068 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc5lQ6A068 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc5lQ6A068 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc5lQ6A068 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms