Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc2Q69ZB8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zcchc2Q69ZB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms