Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn4Q69Z26 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cntn4Q69Z26 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms