Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprdQ64487 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprdQ64487 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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