Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja3Q64448 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja3Q64448 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja3Q64448 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms