Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit1Q64282 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms