Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfdp2Q64163 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfdp2Q64163 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfdp2Q64163 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms