Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccdc18Q640L5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc18Q640L5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc18Q640L5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms