Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vil1Q62468 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vil1Q62468 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vil1Q62468 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vil1Q62468 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms