Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrhQ62361 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrhQ62361 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TrhQ62361 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TrhQ62361 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TrhQ62361 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TrhQ62361 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TrhQ62361 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms