Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf6Q62311 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms