Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18Q62280 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ss18Q62280 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ss18Q62280 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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