Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3bQ62177 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema3bQ62177 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3bQ62177 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms