Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim27Q62158 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim27Q62158 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim27Q62158 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms