Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms