Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pcbp2Q61990 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp2Q61990 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms