Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lama3Q61789 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama3Q61789 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms