Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga7Q61738 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga7Q61738 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga7Q61738 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga7Q61738 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga7Q61738 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga7Q61738 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga7Q61738 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga7Q61738 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga7Q61738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga7Q61738 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga7Q61738 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga7Q61738 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga7Q61738 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga7Q61738 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga7Q61738 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itga7Q61738 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga7Q61738 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga7Q61738 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga7Q61738 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga7Q61738 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga7Q61738 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga7Q61738 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga7Q61738 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga7Q61738 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga7Q61738 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga7Q61738 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga7Q61738 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga7Q61738 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga7Q61738 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga7Q61738 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms