Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EsrrbQ61539 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EsrrbQ61539 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EsrrbQ61539 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms