Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vsx2Q61412 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsx2Q61412 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsx2Q61412 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms