Protein–RNA interactions for Protein: Q61321

Six4, Homeobox protein SIX4, mousemouse

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six4Q61321 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six4Q61321 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six4Q61321 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Six4Q61321 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Six4Q61321 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Six4Q61321 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six4Q61321 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six4Q61321 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six4Q61321 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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